Leikkeen läpinäkyyttä voidaan säätää myös Effect Controls-paletista (Transparency setup). Esimerkiksi ns. bluescreen taustakankaan edessä kuvattu kohde voidaan irrottaan taustastaan valitsemalla asetuksista Blue Screen-toiminto.

Astuksista säädetään Threshold ja Cutoff -arvot niin, että kohde rajautuu halutulla tavalla. Blue Screen taustalle kuvattaessa on pyrittävä mahdollimman tasaväriseen taustaan (vältettävä varjoja). Mikä tahansa väri voidaan määrittää läpinäkyväksi valitsemalla esim. valitsemalla Key Type listasta Croma ja klikkamalla esikatselukuvasta läpinäkyväksi haluttua väriä.

Joskus halutaan video jonkin muodon (esim. valokuvasta rajattu alue) sisään. Silloin luodaan kuva, jossa muoto erottuu hyvin taustasta (esim. musta ja valkoinen). Läpinäkyvyysasetuksista valitaan maskikuva (Image Matte), jolloin videoleike näkyy vain maskin määrittämällä alueella. Image Matte -kuvassa oleva rajaus voi liukua esim. mustasta valkoiseen, jolloin videokuvasta näkyy liukuvarajaisesti vain haluttu osa.

Still-kuvan läpinäkyvyys
Kuvankäsittelyohjelmassa tehty valinta voidaan tallentaa TIFF-kuvan (32 bittinen) Alpha-kanavaan ja soveltaa Alpa-kanavaa projektiin tuodun still-kuvan läpinäkyvyyden määrityksessä. Näin pehmeärajainen valokuvan osa voidaan näyttää videoleikkeen päällä.

Jos halutaan saada esim. valokuvasta rajattu alue liikkumaan videokuvan päällä, pitää valokuvasta ensin poistaa kohteen tausta ja tallentaa se jonkin kohteesta poikkeavan värisellä taustalla. Valittu taustaväri määritetään sitten läpinäkyväksi (Transparency settings) ja määritellään liikerata Motion control -asetuksilla.