Metsäkeskusten hallussa olevien metsätietojen julkisuudesta on keskusteltu viime aikoina esim. metsäluonnon arvokkaiden elinympäristöjen osalta. Metsänomistajien järjestöt ovat edellyttäneet tilakohtaisen metsätiedon tiukkaa salassapitoa niin, että pääsääntöisesti tietoja voidaan luovuttaa vain omistajan luvalla.

Perustuen viranomaisten toiminnan julkisuudesta annettuun lakiin MMM on antanut suosituksen metsäkeskusten hallussa olevien asiakirjojen julkisuudesta. Asia on periaatteellisesti tärkeä yksityisille metsänomistajille.
Suosituksen keskeiset kohdat ovat seuraavat:
1) Valtaosa asiakirjoista on julkisia
2) Metsälakien täytäntöönpanoon liittyvät asiakirjat tulevat julkisiksi saapuessaan metsäkeskukseen. Näitä ovat esim. metsänkäyttöilmoitukset (n. 100 000 kpl/v), taimikoiden perustamisilmoitukset (n. 40 000 kpl/v) ja metsätalouden rahoitushakemukset ja –päätökset (n. 40 000 kpl/v). Metsälakien täytäntöönpanoon liittyviin asiakirjoihin voi sisältyä salassa pidettävää tietoa. Tällaisia ovat esim. epäiltyyn metsälain vastaiseen hakkuuseen liittyvät tiedot, jotka ovat tutkinnallisista syistä salassa pidettäviä, sekä tiedot metsänomistajan taloudellisesta asemasta.
3) Metsäkeskusten hoitamat metsätalouden edistämistehtävät eivät ole julkisen vallan käyttöä, joten siihen ei sovelleta viranomaisen toiminnan julkisuutta koskevia säädöksiä.
Esim. metsäkeskusten maanomistajan toimeksiannosta laatimat tilakohtaiset metsäsuunnitelmat ja metsäneuvonta ovat luottamuksellisia.
Alueellisen metsäsuunnitelman yksittäiseen metsänomistajaan yhdistettävissä olevien tietojen luottamuksellisuudesta on keskusteltu viime aikoina. On esitetty tulkintoja, että mm. metsäkeskuksen olisi luovutettava verottajalle ko. tietoja.
4) Metsälain erityisen tärkeitä elinympäristöjä koskevat yksityiskohtaiset tiedot ovat luottamuksellisia samalla tavoin kuin aluesuunnittelutiedot. Yhteenvetotietoja voidaan luovuttaa, mutta yksityiskohtaiset tiedot tulevat julkisiksi vasta metsälakiin pohjautuvan metsänkäyttöilmoituksen tai muun julkisen asiakirjan yhteydessä.